Kekristenan saka Yaquis yaiku manawa para religius nyebar ing taun 1609, mlebu ing wilayah Sonora.
Sajrone Koloni, Sonora mung cocog karo lereng Sierra Madre Occidental ing watesan entitas kasebut. Wilayah sing mili mangulon saka Kali Yaqui, kalebu Real de la Cieneguilla, diarani Pimería Baja lan wilayah paling lor saka Real kasebut nganti Kali Colorado - wis ana ing negara bagian Amerika Utara ing Arizona - diarani Pimería Alta.
Wilayah Sonoran saiki uga kalebu wilayah cilik ing sisih kidul-kulon sing banjur dikenal kanthi jeneng Pimería, dununge ing negara Chihuahua lan Ostimuri, papan sing dununge ana ing pesisir Teluk California, ing antarane kali Mayo lan Yaqui.
Ing taun 1614 para misionaris Pérez de Rivas lan Pedro Méndez Kristenisasi wong-wong Maya ing wilayah Ostimuri, mbagi misi dadi telung Distrik: Santa Cruz (ing mulut Mayo), Navojoa lan Tesia.
Tepahue digabung karo Cornicaris ing taun 1620. Rama Miguel Godínez nggawe misi San Andrés de Cornicari lan Asunción de Tepahui . Ing taun sing padha, Rektorat San Ignacio didegake, kalebu, saliyane limang misi sing wis kasebut sadurunge, yaiku misi saka Bacúm, Torín lan Rahún, sing ana ing cangkeme Yaqui.
Ing taun 1617, Yaquis diowahi dening wong tuwa Pérez de Rivas lan Tomás Basilio. Sanajan ngalami pemberontakan, kerusuhan, siksa lan pembunuhan, konversi Sonora luwih cepet lan gabungan. Ing abad kaping 17, para Yesuit ngembang lan ngedegake misi Maycoba lan Yecora ing sisih kidul-kulon sing diarani Chínipas.
Misi saka Kali Yaqui ing sisih lor dipérang dadi patang poros: misi saka San Borja nglumpukake misi: Cucumaripa lan Tecoripa , didegaké ing taun 1619; Movas lan Onovas, ing taun 1622; Sahuaripa ing taun 1627; Matape ing taun 1629; Onapa taun 1677 lan Arivechi , ing 1727. Rektorat Tiga Martir Suci ing Jepang sing kalebu Batuco didegake ing taun 1627, Oposura ing taun 1640 lan Bacadeguachi , Guazavas , Santa María Baceraca lan San Miguel Bavispe , didegaké ing 1645. Lan Rektorat San Javier sing nggabungake misi Ures ing taun 1636; Aconchi, Opodepe lan Banámichi ing taun 1639; Cucurpe lan Arizpe ing taun 1648, lan Cuaquiárachi ing taun 1655.
Ing taun 1687, misionaris Eusebio Francisco Kino mlebu ing Pimería Alta lan miwiti misi Rektorat Nuestra Señora de los Dolores, madeg: Caborca, sing ditugasake Francisco Javier Saeta sing njaga korespondensi kanthi dhukungan spiritual, bapak Kino; Atil, Tubutama, Our Lady of Sorrows de Saric, Pitiquito, Aiil, Oquitoa, Magdalena, San Ignacio, Cocóspera lan Imuris.
Sawise diusir saka Yesuit, misi kasebut tanggung jawab kanggo wong Fransiskan, sing ora mbangun maneh lan mung mbatesi nyoba nglestarekake sing wis ana. Sawise para Yesuit wis nggawe pamukiman ing Sinaloa lan Sonora, dheweke banjur ngarahake menyang wilayah California.
